Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 LSINCT5-201ENST00000626215 2647 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 OSTM1-AS1-202ENST00000441184 3334 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms