Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 CACNA1C-209ENST00000399603 7377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 BTBD9-206ENST00000481247 8525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 MAGI1-217ENST00000611645 6398 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.61□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC9.61□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC9.61□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC9.61□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC9.61□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms