Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYNGAP1Q96PV0 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms