Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms