Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms