Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TOPBP1Q92547 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TOPBP1Q92547 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms