Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDU6

GPBAR1, G-protein coupled bile acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBAR1Q8TDU6 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms