Protein–RNA interactions for Protein: Q8TCU6

PREX1, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREX1Q8TCU6 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PREX1Q8TCU6 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PREX1Q8TCU6 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PREX1Q8TCU6 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PREX1Q8TCU6 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PREX1Q8TCU6 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PREX1Q8TCU6 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PREX1Q8TCU6 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PREX1Q8TCU6 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PREX1Q8TCU6 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PREX1Q8TCU6 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PREX1Q8TCU6 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PREX1Q8TCU6 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PREX1Q8TCU6 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PREX1Q8TCU6 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PREX1Q8TCU6 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PREX1Q8TCU6 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PREX1Q8TCU6 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PREX1Q8TCU6 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PREX1Q8TCU6 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PREX1Q8TCU6 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PREX1Q8TCU6 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PREX1Q8TCU6 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PREX1Q8TCU6 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PREX1Q8TCU6 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PREX1Q8TCU6 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PREX1Q8TCU6 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PREX1Q8TCU6 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PREX1Q8TCU6 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PREX1Q8TCU6 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PREX1Q8TCU6 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PREX1Q8TCU6 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PREX1Q8TCU6 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PREX1Q8TCU6 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PREX1Q8TCU6 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PREX1Q8TCU6 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PREX1Q8TCU6 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PREX1Q8TCU6 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PREX1Q8TCU6 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PREX1Q8TCU6 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PREX1Q8TCU6 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PREX1Q8TCU6 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PREX1Q8TCU6 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PREX1Q8TCU6 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PREX1Q8TCU6 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PREX1Q8TCU6 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PREX1Q8TCU6 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PREX1Q8TCU6 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PREX1Q8TCU6 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PREX1Q8TCU6 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PREX1Q8TCU6 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PREX1Q8TCU6 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms