Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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ZNF248Q8NDW4 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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