Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms