Protein–RNA interactions for Protein: Q8N398

VWA5B2, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B2, humanhuman

Predictions only

Length 1,253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA5B2Q8N398 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VWA5B2Q8N398 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms