Protein–RNA interactions for Protein: Q8N283

ANKRD35, Ankyrin repeat domain-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD35Q8N283 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD35Q8N283 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD35Q8N283 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD35Q8N283 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD35Q8N283 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD35Q8N283 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD35Q8N283 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD35Q8N283 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD35Q8N283 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD35Q8N283 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD35Q8N283 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD35Q8N283 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD35Q8N283 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD35Q8N283 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD35Q8N283 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD35Q8N283 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD35Q8N283 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms