Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms