Protein–RNA interactions for Protein: Q86VB7

CD163, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M130, humanhuman

Predictions only

Length 1,156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163Q86VB7 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CD163Q86VB7 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms