Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HECW1Q76N89 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HECW1Q76N89 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HECW1Q76N89 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HECW1Q76N89 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HECW1Q76N89 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HECW1Q76N89 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HECW1Q76N89 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HECW1Q76N89 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HECW1Q76N89 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HECW1Q76N89 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HECW1Q76N89 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HECW1Q76N89 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HECW1Q76N89 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HECW1Q76N89 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HECW1Q76N89 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HECW1Q76N89 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HECW1Q76N89 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HECW1Q76N89 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HECW1Q76N89 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HECW1Q76N89 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HECW1Q76N89 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HECW1Q76N89 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HECW1Q76N89 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HECW1Q76N89 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HECW1Q76N89 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HECW1Q76N89 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HECW1Q76N89 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HECW1Q76N89 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HECW1Q76N89 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HECW1Q76N89 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HECW1Q76N89 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HECW1Q76N89 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HECW1Q76N89 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HECW1Q76N89 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HECW1Q76N89 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HECW1Q76N89 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HECW1Q76N89 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HECW1Q76N89 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HECW1Q76N89 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HECW1Q76N89 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HECW1Q76N89 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HECW1Q76N89 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HECW1Q76N89 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HECW1Q76N89 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HECW1Q76N89 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HECW1Q76N89 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HECW1Q76N89 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HECW1Q76N89 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HECW1Q76N89 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HECW1Q76N89 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HECW1Q76N89 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HECW1Q76N89 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HECW1Q76N89 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HECW1Q76N89 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HECW1Q76N89 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HECW1Q76N89 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HECW1Q76N89 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HECW1Q76N89 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HECW1Q76N89 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HECW1Q76N89 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HECW1Q76N89 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HECW1Q76N89 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HECW1Q76N89 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HECW1Q76N89 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HECW1Q76N89 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HECW1Q76N89 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HECW1Q76N89 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HECW1Q76N89 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HECW1Q76N89 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HECW1Q76N89 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HECW1Q76N89 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HECW1Q76N89 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HECW1Q76N89 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HECW1Q76N89 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HECW1Q76N89 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HECW1Q76N89 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HECW1Q76N89 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HECW1Q76N89 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HECW1Q76N89 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HECW1Q76N89 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HECW1Q76N89 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HECW1Q76N89 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HECW1Q76N89 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HECW1Q76N89 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HECW1Q76N89 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HECW1Q76N89 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HECW1Q76N89 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HECW1Q76N89 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HECW1Q76N89 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HECW1Q76N89 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms