Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW01

CBLN3, Cerebellin-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBLN3Q6UW01 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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CBLN3Q6UW01 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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CBLN3Q6UW01 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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CBLN3Q6UW01 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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CBLN3Q6UW01 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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