Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9A3

ZNF549, Zinc finger protein 549, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF549Q6P9A3 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms