Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPR3

TYW3, tRNA wybutosine-synthesizing protein 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYW3Q6IPR3 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TYW3Q6IPR3 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.3 ms