Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICC9

RTL6, Retrotransposon Gag-like protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL6Q6ICC9 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms