Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

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Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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PRAMEF20Q5VT98 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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PRAMEF20Q5VT98 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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PRAMEF20Q5VT98 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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PRAMEF20Q5VT98 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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