Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3C3

TMEM164, Transmembrane protein 164, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM164Q5U3C3 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM164Q5U3C3 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM164Q5U3C3 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM164Q5U3C3 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM164Q5U3C3 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM164Q5U3C3 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMEM164Q5U3C3 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM164Q5U3C3 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM164Q5U3C3 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM164Q5U3C3 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM164Q5U3C3 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM164Q5U3C3 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMEM164Q5U3C3 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMEM164Q5U3C3 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM164Q5U3C3 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM164Q5U3C3 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMEM164Q5U3C3 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM164Q5U3C3 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMEM164Q5U3C3 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM164Q5U3C3 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM164Q5U3C3 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMEM164Q5U3C3 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM164Q5U3C3 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMEM164Q5U3C3 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM164Q5U3C3 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM164Q5U3C3 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM164Q5U3C3 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM164Q5U3C3 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM164Q5U3C3 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM164Q5U3C3 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM164Q5U3C3 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM164Q5U3C3 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM164Q5U3C3 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM164Q5U3C3 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM164Q5U3C3 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM164Q5U3C3 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM164Q5U3C3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM164Q5U3C3 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM164Q5U3C3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM164Q5U3C3 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM164Q5U3C3 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM164Q5U3C3 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM164Q5U3C3 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM164Q5U3C3 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM164Q5U3C3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM164Q5U3C3 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM164Q5U3C3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM164Q5U3C3 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM164Q5U3C3 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM164Q5U3C3 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM164Q5U3C3 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM164Q5U3C3 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM164Q5U3C3 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM164Q5U3C3 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM164Q5U3C3 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM164Q5U3C3 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM164Q5U3C3 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEM164Q5U3C3 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEM164Q5U3C3 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM164Q5U3C3 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM164Q5U3C3 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM164Q5U3C3 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEM164Q5U3C3 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM164Q5U3C3 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEM164Q5U3C3 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEM164Q5U3C3 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM164Q5U3C3 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM164Q5U3C3 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM164Q5U3C3 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM164Q5U3C3 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM164Q5U3C3 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM164Q5U3C3 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM164Q5U3C3 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM164Q5U3C3 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEM164Q5U3C3 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEM164Q5U3C3 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEM164Q5U3C3 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM164Q5U3C3 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM164Q5U3C3 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM164Q5U3C3 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM164Q5U3C3 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM164Q5U3C3 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM164Q5U3C3 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM164Q5U3C3 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM164Q5U3C3 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM164Q5U3C3 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM164Q5U3C3 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM164Q5U3C3 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEM164Q5U3C3 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms