Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms