Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms