Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms