Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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