Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms