Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGSM1Q2NKQ1 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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