Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP6Q16828 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP6Q16828 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP6Q16828 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP6Q16828 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP6Q16828 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP6Q16828 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP6Q16828 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP6Q16828 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP6Q16828 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP6Q16828 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP6Q16828 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP6Q16828 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP6Q16828 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP6Q16828 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP6Q16828 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP6Q16828 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP6Q16828 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP6Q16828 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DUSP6Q16828 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DUSP6Q16828 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DUSP6Q16828 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DUSP6Q16828 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DUSP6Q16828 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP6Q16828 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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