Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIF1AQ16665 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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