Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms