Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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ZNF239Q16600 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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ZNF239Q16600 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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ZNF239Q16600 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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ZNF239Q16600 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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ZNF239Q16600 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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ZNF239Q16600 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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ZNF239Q16600 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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