Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
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