Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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CNGA3Q16281 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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CNGA3Q16281 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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CNGA3Q16281 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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CNGA3Q16281 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
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