Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 RB1-201ENST00000267163 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 PSMD11-201ENST00000261712 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 SLC38A7-215ENST00000570101 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 MRVI1-216ENST00000547195 6155 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 DLGAP2-214ENST00000612087 10088 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 CHL1-201ENST00000256509 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 ABCA3-201ENST00000301732 6609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 KDM3A-216ENST00000542128 4311 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 LINC01544-201ENST00000567801 5168 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 TDRD9-202ENST00000409874 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 TRUB2-201ENST00000372890 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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VAMP3Q15836 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
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VAMP3Q15836 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC11.43□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 PLEKHB2-202ENST00000403716 4349 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 CHD3-203ENST00000380358 7356 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
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VAMP3Q15836 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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VAMP3Q15836 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 ABI1-213ENST00000536334 3380 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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VAMP3Q15836 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 SPTB-202ENST00000389720 6321 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 ERI1-209ENST00000523898 5036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 ARHGAP33-204ENST00000378944 4219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 FANCA-202ENST00000389301 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 UQCRB-201ENST00000287022 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
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