Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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