Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms