Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
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