Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
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