Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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GTF2H3Q13889 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
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GTF2H3Q13889 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
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GTF2H3Q13889 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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GTF2H3Q13889 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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GTF2H3Q13889 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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GTF2H3Q13889 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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