Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
LAMB3Q13751 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMB3Q13751 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMB3Q13751 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMB3Q13751 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMB3Q13751 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMB3Q13751 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMB3Q13751 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMB3Q13751 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMB3Q13751 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMB3Q13751 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMB3Q13751 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMB3Q13751 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMB3Q13751 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMB3Q13751 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMB3Q13751 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMB3Q13751 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMB3Q13751 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMB3Q13751 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMB3Q13751 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMB3Q13751 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMB3Q13751 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMB3Q13751 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMB3Q13751 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMB3Q13751 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMB3Q13751 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMB3Q13751 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMB3Q13751 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMB3Q13751 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMB3Q13751 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMB3Q13751 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMB3Q13751 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMB3Q13751 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMB3Q13751 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMB3Q13751 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMB3Q13751 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMB3Q13751 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMB3Q13751 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMB3Q13751 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMB3Q13751 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMB3Q13751 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMB3Q13751 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMB3Q13751 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMB3Q13751 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMB3Q13751 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMB3Q13751 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMB3Q13751 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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