Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms