Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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