Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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PMS2P3Q13401 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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PMS2P3Q13401 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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PMS2P3Q13401 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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PMS2P3Q13401 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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PMS2P3Q13401 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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PMS2P3Q13401 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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PMS2P3Q13401 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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PMS2P3Q13401 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
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PMS2P3Q13401 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PMS2P3Q13401 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
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PMS2P3Q13401 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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PMS2P3Q13401 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
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PMS2P3Q13401 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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PMS2P3Q13401 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PMS2P3Q13401 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PMS2P3Q13401 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PMS2P3Q13401 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PMS2P3Q13401 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PMS2P3Q13401 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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