Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms