Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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