Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms