Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
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