Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms