Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CD300CQ08708 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CD300CQ08708 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CD300CQ08708 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CD300CQ08708 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CD300CQ08708 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CD300CQ08708 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
CD300CQ08708 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CD300CQ08708 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CD300CQ08708 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 TRIM80P-201ENST00000455685 2848 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms