Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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PUDPQ08623 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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PUDPQ08623 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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PUDPQ08623 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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PUDPQ08623 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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PUDPQ08623 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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PUDPQ08623 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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PUDPQ08623 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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PUDPQ08623 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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PUDPQ08623 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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PUDPQ08623 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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